Universidade FEDERAL DE GOIÁS
métodos
de estimativas de diversidade
16 a 19 de
novembro de 2010
Prof. Adriano Sanches Melo
Dep. Ecologia, ICB,
Universidade Federal de Goiás
asm. Adrimelo naquele gmail.com
www.ecoevol.ufg.br/adrimelo
www.ecoevol.ufg.br/adrimelo/div
Ementa: Introdução
ao uso do ambiente R. Uso de fórmulas em planilhas eletrônicas.
Índices de riqueza. Rarefação. Curvas de
acumulação de espécie. Ajuste de funções
não-lineares. Estimativas de riqueza de espécies em comunidades e
em tamanhos amostrais extrapolados. Índices e séries de
diversidade. Diversidade alfa, beta e gama. Formas de mensurar diversidade
beta. Partição aditiva da diversidade. Índices de
Similaridade. Teste de Mantel. Análise 'bioenv'.
Análises de Variância Multivariada baseadas em distância.
Análises de co-ocorrência de espécies. Análises de aninhamento.
TODOS ARQUIVOS DESTA
PÁGINA EM ARQUIVO COMPACTADO (~20Mb)
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Programação |
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Terça
(16) |
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08:30-12:00hs
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Introdução
Aula
Aula-folheto Objetivos
de quantificar a diversidade: a) Teoria e b) Aplicações Todos grupos são interessantes Diversidade
e estatística; Uso de métodos de diversidade em trabalhos Uso de
formulas no MS Excel Introdução
ao programa R. Noções de programação.
Riqueza de
espécies
Aula
Aula-folheto Índices
de riqueza Curvas de
acumulação de espécies |
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Quarta (17) |
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08:30-12:00hs
14:00-17:30hs |
Estimativas
de riqueza na comunidade Aula
Aula-folheto Estimativas
de riqueza numa amostra maior Índices
de diversidade Série
de Hill Índices
de equabilidade
Diversidade
alfa, beta e gama
Aula Aula-folheto Formas de
mensurar diversidade beta Partição
aditiva da diversidade |
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Quinta (18) |
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08:00-09:30hs 14:00-17:30hs |
Índices
de Similaridade
Aula Aula-folheto
Teste de
Mantel Análise
Bioenv Manova(s)-d
Aula Aula-folheto |
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Sexta (19) |
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08:30-12:00hs 14:00-17:30hs |
Modelos
nulos
Aula Aula-folheto Análises
de co-ocorrência de espécies Análises
de aninhamento
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Bibliografia sugerida
Segunda
Venables,
W.N., D.M. Smith e The R Development Core Team. 2003.
An introduction to R. Notes on R: A Programming Environment for Data Analysis
and Graphics. Arquivo no formato
pdf dentro do programa R, disponível em www.r-project.org (também
disponível na pasta da disciplina) PDF.
Monteiro,
L.R. e J.L. Gomes Jr (colaborador). 2006. Introdução à
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UNiversidade Estadual do Norte Fluminense, disponível em http://www.r-project.org/
(também
disponível na pasta da disciplina) PDF.
Terça
Gotelli,
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Quarta
Estimadores
de riqueza
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Índices
de diversidade
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Peet, R.K. 1974. The measurement of
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Índices de
equitabilidade
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Série de
Hill
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Quinta
Índices de Similaridade
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Análise 'bioenv'
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Manova-d
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Pillar, V.D. e L. Orlóci. 1996. On randomization
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Warton, D. e H. Hudson. 2004. A MANOVA
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Sexta
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co-ocorrência de espécies
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Gotelli, N.J. e G.L. Entsminger. 2005. EcoSim: Null models software for Ecology (a
seção de ajuda sobre co-ocorrência é excelente) http://www.garyentsminger.com/ecosim/index.htm
Gotelli,
N.J e G.R. Graves. 1996. Null Models in Ecology. Smithsonian
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Análises
de aninhamento
Almeida-Neto, M., P. Guimarães, P.R.
Guimarães Jr.,R.D.
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analysis in ecological systems: reconciling concept and measurement. Oikos 117: 1227-1239. PDF
Ulrich, W., M. Almeida-Neto
e N.J. Gotelli. 2009. A consumer's guide to nestedness analysis. Oikos 118:
3-17. PDF